세종기지는 서남극 남극반도에 평행하게 발달한 남쉐틀랜드
군도(South Shetland Islands)의 킹조지섬과 넬슨섬으로 둘러싸인
맥스웰만(Maxwell Bay)연안에 있다.
세종기지의 정확한 위치는 맥스웰만의 동편에 있는 마리안 소만의 남쪽 해안이다. 육지로 따지면, 킹조지섬 바튼반도의 북서 해안이라고 할 수 있다. 세종기지가 위치하고 있는 남쉐틀랜드 군도의 킹죠지섬은 남극에서 문명세계(남미)와 가장 가깝고 얼음의 장애가 적어, 세종기지 이외에도 아르헨티나, 러시아, 칠레, 우루과이, 브라질, 폴랜드, 중국 (총 8개국)의 상주 기지가 있다. 넬슨섬에는 체코의 민간 기지 (대피소 수준)가 있다.